Государственный музей истории культуры Узбекистана входит в структуру Самаркандского государственного объединенного историко-архитектурного и художественного музея. Это один из старейших музеев Узбекистана, основанный в 1896 году.
За время существования музея в его фонды вошли десятки тысяч уникальных экспонатов, имеющих особую культурную и историческую ценность. Структура музея истории и культуры Узбекистана в Самарканде включает в себя пять тематических отделов: отдел истории, отдел искусства, отдел постоянных и передвижных выставок и отдел фондов археологии, этнографии, изобразительного искусства, нумизматики и отдел маркетинга.
Здесь хранятся ювелирные украшения эпохи бронзы, зороастрийские оссуарии и предметы культа, шахматы VIII века, несколько тысяч оригинальных полотен выдающихся узбекских художников начала XX века, а также трагически известный пленочный фильм М. Каюмова «Вскрытие гробницы Амира Тимура», снятый накануне Второй мировой войны в 1941 году.
Музей обладает хорошей коллекцией древней и средневековой керамики, металла и стекла, а также ганчевого декора. В фонде нумизматики Музея истории культуры Узбекистана собрано около 30 тыс. монет не только первых государств Центральноазиатского региона, но и Причерноморья, Древней Греции и Древнего Рима. В числе редких экспонатов три серебряные чаши V-VI вв., найденные в самаркандском поселке Челек.
Этнографическая коллекция представляет около 20 тыс. единиц национальной одежды, золотошвейных изделий, ковров, преимущественно XIX-XX веков. Здесь же можно увидеть чеканные ножи и металлическую посуду, в основном самаркандских народных мастеров. Гордится самаркандский музей и глобусом ходжентского просветителя XIX века Ходжи Юсуфа Мирфаязова.
С 1978 по 2010 гг. Музей истории культуры Узбекистана в Самарканде располагался в специально построенном здании на знаменитой площади Регистан. С 2010 года решением правительства музей был перемещен на улицу Улугбека. Несколько лет музей находился на ремонте и 1 сентября 2014 года состоялось торжественное открытие отремонтированного здания музея.